Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2B9

Rps6ka4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka4Q9Z2B9 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms