Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD7

Dysf, Dysferlin, mousemouse

Predictions only

Length 2,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DysfQ9ESD7 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms