Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Tspan4Q9DCK3 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Tspan4Q9DCK3 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Tspan4Q9DCK3 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Tspan4Q9DCK3 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
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Tspan4Q9DCK3 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Tspan4Q9DCK3 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Tspan4Q9DCK3 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Tspan4Q9DCK3 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Tspan4Q9DCK3 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Tspan4Q9DCK3 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Tspan4Q9DCK3 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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