Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
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