Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Chmp3Q9CQ10 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Chmp3Q9CQ10 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Chmp3Q9CQ10 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Chmp3Q9CQ10 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Chmp3Q9CQ10 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp3Q9CQ10 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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