Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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