Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

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Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Rab11fip3Q8CHD8 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab11fip3Q8CHD8 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab11fip3Q8CHD8 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab11fip3Q8CHD8 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab11fip3Q8CHD8 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Rab11fip3Q8CHD8 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab11fip3Q8CHD8 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab11fip3Q8CHD8 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab11fip3Q8CHD8 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab11fip3Q8CHD8 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab11fip3Q8CHD8 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab11fip3Q8CHD8 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab11fip3Q8CHD8 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab11fip3Q8CHD8 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab11fip3Q8CHD8 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab11fip3Q8CHD8 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab11fip3Q8CHD8 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Rab11fip3Q8CHD8 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab11fip3Q8CHD8 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Rab11fip3Q8CHD8 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Rab11fip3Q8CHD8 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
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Rab11fip3Q8CHD8 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Rab11fip3Q8CHD8 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Rab11fip3Q8CHD8 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Rab11fip3Q8CHD8 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Rab11fip3Q8CHD8 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab11fip3Q8CHD8 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
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Rab11fip3Q8CHD8 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab11fip3Q8CHD8 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab11fip3Q8CHD8 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab11fip3Q8CHD8 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab11fip3Q8CHD8 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab11fip3Q8CHD8 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab11fip3Q8CHD8 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab11fip3Q8CHD8 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab11fip3Q8CHD8 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab11fip3Q8CHD8 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab11fip3Q8CHD8 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab11fip3Q8CHD8 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab11fip3Q8CHD8 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab11fip3Q8CHD8 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab11fip3Q8CHD8 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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