Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 4060.5 ms