Protein–RNA interactions for Protein: Q8C601

BC049762, BC049762 protein, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC049762Q8C601 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC049762Q8C601 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms