Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Dsg1cQ7TSF0 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms