Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nphp3Q7TNH6 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms