Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
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