Protein–RNA interactions for Protein: Q64448

Gja3, Gap junction alpha-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja3Q64448 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja3Q64448 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms