Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fam208bQ5DTT3 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms