Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU56

Gm29609, Predicted gene 29609, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29609Q3UU56 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm29609Q3UU56 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm29609Q3UU56 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm29609Q3UU56 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm29609Q3UU56 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm29609Q3UU56 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm29609Q3UU56 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm29609Q3UU56 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm29609Q3UU56 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm29609Q3UU56 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm29609Q3UU56 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm29609Q3UU56 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm29609Q3UU56 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm29609Q3UU56 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm29609Q3UU56 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm29609Q3UU56 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm29609Q3UU56 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm29609Q3UU56 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm29609Q3UU56 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
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Gm29609Q3UU56 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Gm29609Q3UU56 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Gm29609Q3UU56 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Gm29609Q3UU56 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Gm29609Q3UU56 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Gm29609Q3UU56 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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