Protein–RNA interactions for Protein: Q06335

Aplp2, Amyloid-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aplp2Q06335 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Aplp2Q06335 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms