Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pitx2P97474 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms