Protein–RNA interactions for Protein: P29594

Casp2, Caspase-2, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp2P29594 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Casp2P29594 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Casp2P29594 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Casp2P29594 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Casp2P29594 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Casp2P29594 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Casp2P29594 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp2P29594 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp2P29594 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp2P29594 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp2P29594 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp2P29594 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp2P29594 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp2P29594 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp2P29594 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp2P29594 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp2P29594 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp2P29594 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp2P29594 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp2P29594 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp2P29594 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp2P29594 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp2P29594 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp2P29594 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp2P29594 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp2P29594 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp2P29594 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp2P29594 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp2P29594 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp2P29594 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp2P29594 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp2P29594 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp2P29594 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp2P29594 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp2P29594 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp2P29594 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp2P29594 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp2P29594 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp2P29594 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp2P29594 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp2P29594 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp2P29594 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp2P29594 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp2P29594 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp2P29594 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp2P29594 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp2P29594 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp2P29594 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp2P29594 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp2P29594 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp2P29594 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp2P29594 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp2P29594 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp2P29594 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp2P29594 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp2P29594 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp2P29594 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp2P29594 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp2P29594 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp2P29594 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp2P29594 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp2P29594 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp2P29594 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp2P29594 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp2P29594 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp2P29594 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp2P29594 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp2P29594 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp2P29594 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp2P29594 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp2P29594 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp2P29594 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp2P29594 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp2P29594 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp2P29594 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp2P29594 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Casp2P29594 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Casp2P29594 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Casp2P29594 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Casp2P29594 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Casp2P29594 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Casp2P29594 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Casp2P29594 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Casp2P29594 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Casp2P29594 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Casp2P29594 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Casp2P29594 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Casp2P29594 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Casp2P29594 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Casp2P29594 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Casp2P29594 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Casp2P29594 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Casp2P29594 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Casp2P29594 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Casp2P29594 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Casp2P29594 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Casp2P29594 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Casp2P29594 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Casp2P29594 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Casp2P29594 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms