Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
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Hoxd10P28359 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
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Hoxd10P28359 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
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Hoxd10P28359 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
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Hoxd10P28359 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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Hoxd10P28359 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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Hoxd10P28359 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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Hoxd10P28359 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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