Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Kmt2a-202ENSMUST00000114689 16470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Thsd7a-206ENSMUST00000172356 10998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Son-204ENSMUST00000119368 7529 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 4931406P16Rik-202ENSMUST00000108074 6224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Atg16l2-201ENSMUST00000120267 6459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Ncor2-201ENSMUST00000055256 7780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl13aP19253 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms