Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC8.46□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC8.46□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms