Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Aebp2-205ENSMUST00000160836 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Zfp942-201ENSMUST00000074295 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Gm15161-201ENSMUST00000117340 387 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Etfbkmt-207ENSMUST00000147934 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 1700129C05Rik-203ENSMUST00000162271 325 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Mnd1-ps-201ENSMUST00000162462 604 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Gm3573-201ENSMUST00000168673 898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Gm3486-201ENSMUST00000169361 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Gm4181-201ENSMUST00000170249 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 V1rg10-201ENSMUST00000183378 937 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 1700015G11Rik-202ENSMUST00000185758 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Gm6657-203ENSMUST00000188791 531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Gm18597-201ENSMUST00000209519 694 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Olfr863-ps1-201ENSMUST00000213073 929 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
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Hoxb4P10284 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Pmis2-201ENSMUST00000051495 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Olfr684-201ENSMUST00000060893 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Gm14024-201ENSMUST00000141964 560 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 AW495222-202ENSMUST00000149839 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms