Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms