Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms