Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb3D3Z6J4 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms