Protein–RNA interactions for Protein: C0HKD8

Mfap1a, Microfibrillar-associated protein 1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfap1aC0HKD8 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mfap1aC0HKD8 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms