Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Rtf1A2AQ19 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Rtf1A2AQ19 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Rtf1A2AQ19 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Rtf1A2AQ19 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Rtf1A2AQ19 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Rtf1A2AQ19 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Rtf1A2AQ19 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rtf1A2AQ19 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms