Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Nps-202ENSMUST00000210697 1082 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Ntm-202ENSMUST00000115236 1072 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Ly6e-207ENSMUST00000187606 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Itgb4A2A863 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb4A2A863 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb4A2A863 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb4A2A863 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb4A2A863 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb4A2A863 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb4A2A863 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb4A2A863 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb4A2A863 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb4A2A863 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb4A2A863 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb4A2A863 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb4A2A863 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb4A2A863 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb4A2A863 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb4A2A863 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb4A2A863 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb4A2A863 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb4A2A863 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms