Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S5

Cldn15, Claudin-15, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn15Q9Z0S5 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn15Q9Z0S5 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn15Q9Z0S5 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn15Q9Z0S5 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn15Q9Z0S5 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn15Q9Z0S5 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn15Q9Z0S5 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn15Q9Z0S5 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn15Q9Z0S5 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn15Q9Z0S5 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn15Q9Z0S5 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn15Q9Z0S5 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn15Q9Z0S5 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn15Q9Z0S5 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn15Q9Z0S5 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn15Q9Z0S5 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn15Q9Z0S5 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn15Q9Z0S5 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn15Q9Z0S5 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn15Q9Z0S5 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn15Q9Z0S5 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn15Q9Z0S5 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn15Q9Z0S5 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn15Q9Z0S5 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn15Q9Z0S5 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn15Q9Z0S5 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn15Q9Z0S5 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn15Q9Z0S5 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn15Q9Z0S5 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn15Q9Z0S5 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn15Q9Z0S5 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn15Q9Z0S5 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn15Q9Z0S5 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn15Q9Z0S5 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn15Q9Z0S5 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn15Q9Z0S5 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn15Q9Z0S5 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn15Q9Z0S5 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn15Q9Z0S5 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn15Q9Z0S5 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn15Q9Z0S5 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn15Q9Z0S5 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn15Q9Z0S5 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn15Q9Z0S5 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn15Q9Z0S5 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn15Q9Z0S5 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn15Q9Z0S5 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn15Q9Z0S5 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn15Q9Z0S5 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn15Q9Z0S5 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn15Q9Z0S5 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn15Q9Z0S5 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn15Q9Z0S5 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn15Q9Z0S5 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn15Q9Z0S5 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn15Q9Z0S5 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn15Q9Z0S5 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn15Q9Z0S5 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
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Cldn15Q9Z0S5 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Cldn15Q9Z0S5 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Cldn15Q9Z0S5 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn15Q9Z0S5 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn15Q9Z0S5 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn15Q9Z0S5 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn15Q9Z0S5 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn15Q9Z0S5 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn15Q9Z0S5 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn15Q9Z0S5 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn15Q9Z0S5 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn15Q9Z0S5 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn15Q9Z0S5 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn15Q9Z0S5 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn15Q9Z0S5 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn15Q9Z0S5 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn15Q9Z0S5 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn15Q9Z0S5 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn15Q9Z0S5 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn15Q9Z0S5 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn15Q9Z0S5 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn15Q9Z0S5 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn15Q9Z0S5 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn15Q9Z0S5 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn15Q9Z0S5 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn15Q9Z0S5 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn15Q9Z0S5 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn15Q9Z0S5 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms