Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H8

Clip2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip2Q9Z0H8 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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