Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmed2Q9R0Q3 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmed2Q9R0Q3 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmed2Q9R0Q3 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmed2Q9R0Q3 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmed2Q9R0Q3 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmed2Q9R0Q3 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmed2Q9R0Q3 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmed2Q9R0Q3 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmed2Q9R0Q3 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmed2Q9R0Q3 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmed2Q9R0Q3 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmed2Q9R0Q3 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmed2Q9R0Q3 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmed2Q9R0Q3 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmed2Q9R0Q3 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmed2Q9R0Q3 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmed2Q9R0Q3 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmed2Q9R0Q3 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmed2Q9R0Q3 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmed2Q9R0Q3 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmed2Q9R0Q3 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmed2Q9R0Q3 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmed2Q9R0Q3 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmed2Q9R0Q3 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmed2Q9R0Q3 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmed2Q9R0Q3 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmed2Q9R0Q3 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmed2Q9R0Q3 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmed2Q9R0Q3 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmed2Q9R0Q3 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmed2Q9R0Q3 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmed2Q9R0Q3 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmed2Q9R0Q3 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmed2Q9R0Q3 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmed2Q9R0Q3 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmed2Q9R0Q3 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed2Q9R0Q3 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed2Q9R0Q3 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed2Q9R0Q3 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed2Q9R0Q3 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed2Q9R0Q3 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed2Q9R0Q3 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed2Q9R0Q3 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed2Q9R0Q3 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed2Q9R0Q3 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed2Q9R0Q3 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed2Q9R0Q3 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed2Q9R0Q3 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed2Q9R0Q3 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed2Q9R0Q3 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed2Q9R0Q3 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed2Q9R0Q3 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed2Q9R0Q3 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed2Q9R0Q3 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed2Q9R0Q3 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed2Q9R0Q3 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed2Q9R0Q3 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed2Q9R0Q3 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed2Q9R0Q3 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed2Q9R0Q3 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed2Q9R0Q3 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed2Q9R0Q3 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed2Q9R0Q3 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed2Q9R0Q3 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed2Q9R0Q3 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed2Q9R0Q3 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmed2Q9R0Q3 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmed2Q9R0Q3 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmed2Q9R0Q3 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmed2Q9R0Q3 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmed2Q9R0Q3 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmed2Q9R0Q3 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmed2Q9R0Q3 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmed2Q9R0Q3 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmed2Q9R0Q3 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmed2Q9R0Q3 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmed2Q9R0Q3 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmed2Q9R0Q3 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmed2Q9R0Q3 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmed2Q9R0Q3 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmed2Q9R0Q3 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmed2Q9R0Q3 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmed2Q9R0Q3 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmed2Q9R0Q3 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmed2Q9R0Q3 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmed2Q9R0Q3 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmed2Q9R0Q3 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmed2Q9R0Q3 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmed2Q9R0Q3 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmed2Q9R0Q3 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmed2Q9R0Q3 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmed2Q9R0Q3 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmed2Q9R0Q3 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmed2Q9R0Q3 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmed2Q9R0Q3 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmed2Q9R0Q3 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmed2Q9R0Q3 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmed2Q9R0Q3 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmed2Q9R0Q3 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms