Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Trpc5Q9QX29 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Trpc5Q9QX29 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Trpc5Q9QX29 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Trpc5Q9QX29 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Trpc5Q9QX29 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Trpc5Q9QX29 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Trpc5Q9QX29 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpc5Q9QX29 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
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Trpc5Q9QX29 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trpc5Q9QX29 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Trpc5Q9QX29 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Trpc5Q9QX29 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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