Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS7

Cacna1f, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1F, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1fQ9JIS7 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna1fQ9JIS7 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna1fQ9JIS7 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna1fQ9JIS7 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna1fQ9JIS7 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna1fQ9JIS7 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna1fQ9JIS7 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna1fQ9JIS7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna1fQ9JIS7 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna1fQ9JIS7 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna1fQ9JIS7 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna1fQ9JIS7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna1fQ9JIS7 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna1fQ9JIS7 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna1fQ9JIS7 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna1fQ9JIS7 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna1fQ9JIS7 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna1fQ9JIS7 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna1fQ9JIS7 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna1fQ9JIS7 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna1fQ9JIS7 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna1fQ9JIS7 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna1fQ9JIS7 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna1fQ9JIS7 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna1fQ9JIS7 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna1fQ9JIS7 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna1fQ9JIS7 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna1fQ9JIS7 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna1fQ9JIS7 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna1fQ9JIS7 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna1fQ9JIS7 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna1fQ9JIS7 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna1fQ9JIS7 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna1fQ9JIS7 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna1fQ9JIS7 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna1fQ9JIS7 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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