Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Med27Q9DB40 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms