Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smco2Q9DA21 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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