Protein–RNA interactions for Protein: Q9D478

Odf2l, Outer dense fiber protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2lQ9D478 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Odf2lQ9D478 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Odf2lQ9D478 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Odf2lQ9D478 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Odf2lQ9D478 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Odf2lQ9D478 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Odf2lQ9D478 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Odf2lQ9D478 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Odf2lQ9D478 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Odf2lQ9D478 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Odf2lQ9D478 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Odf2lQ9D478 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Odf2lQ9D478 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Odf2lQ9D478 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Odf2lQ9D478 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Odf2lQ9D478 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Odf2lQ9D478 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Odf2lQ9D478 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Odf2lQ9D478 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Odf2lQ9D478 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Odf2lQ9D478 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Odf2lQ9D478 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Odf2lQ9D478 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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Odf2lQ9D478 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Odf2lQ9D478 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Odf2lQ9D478 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Odf2lQ9D478 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Odf2lQ9D478 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Odf2lQ9D478 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Odf2lQ9D478 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Odf2lQ9D478 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Odf2lQ9D478 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Odf2lQ9D478 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Odf2lQ9D478 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Odf2lQ9D478 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Odf2lQ9D478 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Odf2lQ9D478 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Odf2lQ9D478 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Odf2lQ9D478 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Odf2lQ9D478 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Odf2lQ9D478 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Odf2lQ9D478 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Odf2lQ9D478 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Odf2lQ9D478 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Odf2lQ9D478 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Odf2lQ9D478 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Odf2lQ9D478 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Odf2lQ9D478 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Odf2lQ9D478 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Odf2lQ9D478 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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