Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms