Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms