Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Ssh3Q8K330 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Ssh3Q8K330 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Ssh3Q8K330 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms