Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nop58Q6DFW4 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms