Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc18Q640L5 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc18Q640L5 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc18Q640L5 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc18Q640L5 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc18Q640L5 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc18Q640L5 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc18Q640L5 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc18Q640L5 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc18Q640L5 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc18Q640L5 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc18Q640L5 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc18Q640L5 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc18Q640L5 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc18Q640L5 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc18Q640L5 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc18Q640L5 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc18Q640L5 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc18Q640L5 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc18Q640L5 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc18Q640L5 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc18Q640L5 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc18Q640L5 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc18Q640L5 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc18Q640L5 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc18Q640L5 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc18Q640L5 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc18Q640L5 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc18Q640L5 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc18Q640L5 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc18Q640L5 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc18Q640L5 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc18Q640L5 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc18Q640L5 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc18Q640L5 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc18Q640L5 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc18Q640L5 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc18Q640L5 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc18Q640L5 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc18Q640L5 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
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Ccdc18Q640L5 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc18Q640L5 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
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Ccdc18Q640L5 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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Ccdc18Q640L5 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
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Ccdc18Q640L5 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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Ccdc18Q640L5 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
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Ccdc18Q640L5 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc18Q640L5 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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