Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

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Length 456 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Foxd1Q61345 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Foxd1Q61345 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Foxd1Q61345 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Foxd1Q61345 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Foxd1Q61345 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Foxd1Q61345 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Foxd1Q61345 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Foxd1Q61345 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Foxd1Q61345 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Foxd1Q61345 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Foxd1Q61345 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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