Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

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Length 599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rtl5Q5DTT4 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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Rtl5Q5DTT4 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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Rtl5Q5DTT4 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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Rtl5Q5DTT4 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rtl5Q5DTT4 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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Rtl5Q5DTT4 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rtl5Q5DTT4 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rtl5Q5DTT4 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rtl5Q5DTT4 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rtl5Q5DTT4 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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Rtl5Q5DTT4 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rtl5Q5DTT4 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rtl5Q5DTT4 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rtl5Q5DTT4 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rtl5Q5DTT4 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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