Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ22

Gm648, Gene model 648, (NCBI), mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm648Q3UJ22 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm648Q3UJ22 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm648Q3UJ22 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm648Q3UJ22 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm648Q3UJ22 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm648Q3UJ22 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm648Q3UJ22 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm648Q3UJ22 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Gm648Q3UJ22 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm648Q3UJ22 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm648Q3UJ22 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Gm648Q3UJ22 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm648Q3UJ22 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm648Q3UJ22 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm648Q3UJ22 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm648Q3UJ22 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm648Q3UJ22 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm648Q3UJ22 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm648Q3UJ22 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm648Q3UJ22 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm648Q3UJ22 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Gm648Q3UJ22 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Gm648Q3UJ22 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Gm648Q3UJ22 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Gm648Q3UJ22 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm648Q3UJ22 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm648Q3UJ22 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Gm648Q3UJ22 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm648Q3UJ22 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Gm648Q3UJ22 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm648Q3UJ22 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm648Q3UJ22 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm648Q3UJ22 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm648Q3UJ22 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm648Q3UJ22 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm648Q3UJ22 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm648Q3UJ22 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm648Q3UJ22 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm648Q3UJ22 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm648Q3UJ22 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm648Q3UJ22 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm648Q3UJ22 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm648Q3UJ22 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm648Q3UJ22 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm648Q3UJ22 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm648Q3UJ22 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Gm648Q3UJ22 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm648Q3UJ22 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm648Q3UJ22 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Gm648Q3UJ22 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm648Q3UJ22 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm648Q3UJ22 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm648Q3UJ22 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Gm648Q3UJ22 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm648Q3UJ22 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm648Q3UJ22 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm648Q3UJ22 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm648Q3UJ22 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm648Q3UJ22 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm648Q3UJ22 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm648Q3UJ22 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm648Q3UJ22 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm648Q3UJ22 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm648Q3UJ22 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm648Q3UJ22 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm648Q3UJ22 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm648Q3UJ22 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm648Q3UJ22 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm648Q3UJ22 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm648Q3UJ22 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm648Q3UJ22 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm648Q3UJ22 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm648Q3UJ22 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm648Q3UJ22 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm648Q3UJ22 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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