Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Nkx6-3Q3UHX8 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Nkx6-3Q3UHX8 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
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Nkx6-3Q3UHX8 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Nkx6-3Q3UHX8 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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