Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms