Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spatc1Q148B6 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spatc1Q148B6 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spatc1Q148B6 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Spatc1Q148B6 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Spatc1Q148B6 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spatc1Q148B6 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Spatc1Q148B6 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spatc1Q148B6 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spatc1Q148B6 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Spatc1Q148B6 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Spatc1Q148B6 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Spatc1Q148B6 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Spatc1Q148B6 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Spatc1Q148B6 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Spatc1Q148B6 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Spatc1Q148B6 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Spatc1Q148B6 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Spatc1Q148B6 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Spatc1Q148B6 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms