Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms