Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Cnn1Q08091 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
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