Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms